Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms