Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PfplQ5RKV8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PfplQ5RKV8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms