Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms