Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms