Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms