Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps41Q5KU39 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms