Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grhl3Q5FWH3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grhl3Q5FWH3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms