Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3558Q5FWC9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms