Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms