Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmtc2Q56A06 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmtc2Q56A06 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms