Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd28Q505D1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd28Q505D1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms