Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp235Q499D5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms