Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5935Q497S0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5935Q497S0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms