Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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