Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms