Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms