Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms