Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms