Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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Usp48Q3V0C5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Usp48Q3V0C5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms