Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc27Q3V036 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc27Q3V036 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms