Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed1Q3V009 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms