Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms