Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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