Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb48Q3UW22 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms