Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms