Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb2Q3UUV9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms