Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap1Q3UUV5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms