Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef9Q3UTH8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms