Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms