Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TceancQ3US16 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms