Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms