Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgef40Q3UPH7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgef40Q3UPH7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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