Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms