Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms