Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms