Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms