Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxosQ3UL53 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms