Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ceacam12Q3UKP4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms