Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms