Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms