Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nkx6-3Q3UHX8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nkx6-3Q3UHX8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nkx6-3Q3UHX8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nkx6-3Q3UHX8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms