Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms