Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms