Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6Q4

Pik3r6, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r6Q3U6Q4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3r6Q3U6Q4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms