Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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