Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q3U595 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q3U595 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U595 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1309.6 ms