Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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