Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam193bQ3U2K0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam193bQ3U2K0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms