Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lrrn4clQ3TYX2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lrrn4clQ3TYX2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrn4clQ3TYX2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lrrn4clQ3TYX2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lrrn4clQ3TYX2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms