Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc28Q3TX51 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms